Der Basler Künstler Albert Schilling hat auf dem Vorplatz der Kirche die Steinskulptur "fliessende Gnade", den Grundstein sowie das eindrückliche Portal geschaffen. Der Altarraum wurde von Hans Christen gestaltet. Mit dem wunderschönen Farbfenster von Ferdinand Gehr und der plastischen, kunstvollen Ausstattung von Hans Christen ist die Kirche Bruder Klaus ein Ort, der zur Einkehr und zur Gemeinschaft einlädt.
Das Glasfenster stammt von Ferdinand Gehr und „umweht wie eine transparente Flagge“ die zum Gottesdienst versammelte Gemeinde. Der blaue untere und der rötliche obere Rahmen des Glasfensters fangen die Architektur der Kirche auf. Im Inneren des Fensters stellt Ferdinand Gehr die drei göttlichen Personen und ihre Werke in der Welt dar. Über dem Chorraum schwebt in lichtem Mantel Gott der Schöpfer. Auf seinen Armen trägt er die Welt. Im zweiten Bild erscheint der Heilige Geist aus dem flammenden Feuer als mächtige Taube. Dieses Bild verweist auf Pfingsten. Rechts schreitet Jesus Christus als Lamm Gottes, Mensch geworden, in die Welt hinein (grüne Farbe). In jedem der drei Bilder tragen und giessen goldene Schalen den Segen und die Gnade Gottes in die irdische Welt.
aus: Robert Lang: Bruder Klaus Basel. Kunstführer Nr. 753, Schweizer Reihe Nr. 34. Verlag Schnell und Steiner, München und Zürich 1964.